逗留在有异生兽出没的废工场中的少女里奈，在孤门及西条的保护下奇迹般的生还了。但是为了救助里奈而违背命令单独行动的孤门，却被上级追究了责任。也因此孤门那“不能牺牲任何一人的生命”的使命感被驳斥为“毫无价值的理想”，孤门因而感到困惑。 在这样的事态中，孤门遇见了住院中的里奈小妹妹。但是里奈却一点都不记得有关孤门的事。在为此陷入混乱的孤门面前，“记忆警察”的领队“首藤沙耶(日高瞳 饰)”出现了。