1989年，13岁的郭子健看了一部动作犯罪片《英雄本色》，从此一头扎进了电影的世界。他曾以平面设计为生，最终还是没能抗拒内心对电影的痴迷，转行从底层做起，一步步走上了导演的位置 。
2008年，执导由余文乐、冼色丽、樊少皇联合主演的剧情片《青苔》，获得第28届香港电影金像奖最佳新晋导演奖 。
2010年，执导由李治廷、文咏珊合作主演的爱情片《为你钟情》 。同年，与郑思杰联合执导动作片《打擂台》，该片获得第17届香港电影评论学会大奖最佳电影、第30届香港电影金像奖最佳电影等，郭子健凭借此片获得第30届金像奖最佳导演提名 。
2013年，与周星驰联合执导由文章、舒淇、黄渤等合作主演的古装神话片《西游·降魔篇》，获得第50届台湾电影金马奖最佳跨媒介改编剧本奖 。
2014年，执导以香港消防处特种救援队为题材的灾难片《救火英雄》，该片由谢霆锋、余文乐、任达华联合主演，获得第33届香港电影金像奖最佳导演提名 。
2015年 ，执导由彭于晏、倪妮、欧豪联袂主演的古装爱情片《悟空传》，该片于2017年7月13日在中国大陆上映 。
2019年9月21日，主演电影《古董局中局》 。2021年11月19日，执导由雷佳音、李现、辛芷蕾领衔主演，葛优特别主演的冒险电影《古董局中局》发布定档海报，官宣定档12月3日，12月2日超前点映 。
对于内地很多观众来说，郭子健的名字有一定陌生感，但是说到他拍过的电影就没有人不知道了，他用自己的态度与才华赢得了演员的力挺。《救火英雄》是郭子健独立执导的第5部电影，该片不论是制作规模还是类型模式，都开创了香港电影的新纪元 （网易娱乐评）。
郭子健是一个很有冲劲的人，拍摄的东西显得很新，自己也非常喜欢演戏，但他演的时候就觉得很夸张 （谢霆锋评）。他能把几个人不同的背景、性格、包袱、矛盾，都讲得非常到位 （余文乐评）。他很有追求，在拍戏过程中用心、用力，甚至有时候会徘徊，有时候会不知所措，他很鲜活，也会大有作为 （胡军评）。