1985年起，水树奈奈参加了社区内举办的歌唱比赛。此后，小学和初中的水树多次参加在四国地区的各类歌唱比赛并获奖。1993年，以本名“近藤奈奈”名义录制单曲《つがざくら》 。1994年6月，获“濑户内卡拉OK歌谣赛对抗赛 十周年记念全国大赛”冠军，并因此获其中一名评判赏识，邀请她初中毕业后往东京发展 。
初中毕业后，前往东京进入堀越高校就读高中，选择了容许较低出席率的综合艺能活动课程。
高中1年级时，事务所向水树奈奈提出进行配音工作的建议，于是，接受该建议的水树奈奈在高中二年级开始入读了代代木动画学院声优科，在此接受配音演员的训练。高中毕业后，在吉祥寺的美体沙龙做着一份时薪850日元的兼职工作 。
1997年3月，代代木动画学院声优科毕业，作为学业优秀、品行端正的10名毕业生之一获颁了“堀越赏” ，成为继草彅刚之后以艺能科毕业而获得该奖赏的第二人 。
期间，水树奈奈所属的事务所破产倒闭，由于堀越高中入学需要事务所在籍的条件限制，水树面临堀越高中退学的危机，不久后她的歌唱导师成立了“产光音乐”事务所，水树得以加入该事务所并解除退学的危机。
1998年3月，从堀越高等学校毕业后正式开始演艺生涯。
水树奈奈的父亲为近藤信光，母亲为近藤训子 。名字的由来是因为父亲是演员冈田奈奈的粉丝 ，因为避免本名“近藤奈奈”与歌手近藤名奈出现混淆，所以决定使用“水树奈奈”作为艺名 。
她的妹妹近藤美香为Daisy×Daisy主唱，艺名为Mika 。
家庭环境并不富裕，所以学生时代是学校里少数几乎全勤的学生，并为领奖学金以贴补家用而十分用功。2008年10月29日，水树奈奈的父亲去世 。
持有书友会毛笔部七段、珠算三级、心算二级 、自动档汽车驾驶执照等资格。
2020年7月6日，与作为音乐界从业者的丈夫登记结婚 。11月6号，通过官网宣布怀孕，目前已经进入安定期，将暂时工作一段时间 。2021年3月16日，在个人网站上宣布第1个孩子出生。
2010年2月20日，被任命为首任“新居滨观光大使”。
2011年3月27日，参与niconico为2011年东日本大地震举行的赈灾款募金义演，募集总金额达到了315万1800日元。
2012年4月17日，接受出身地爱媛县的“伊予观光大使”的任命 。
水树奈奈唱功的炉火纯青，在演唱会上的表现尤为淋漓尽致。她以她强势的歌唱实力，演绎首首难度颇高的音乐歌曲。尤其擅长高音和颤音的水树奈奈，演唱快歌时爆发力、节奏感、感染力十足；演唱慢歌时，又显得迂回婉转、颤人心扉。所以，对声音的把握恰到好处的她比起其他声优歌手，音乐风格更加多变，每一出都是惊喜 。（21cn评）
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